梅故校長貽琦先生於民國三十七年冬，北平淪陷赴美後，在政府的推動 與美國友邦訂立原子能和平用途協定之下，運用清華在美保管的基金，而於民國48年建造反應器，於民國50年4月13日完成初次臨界，為首座安裝於 東亞及中華民國的百萬瓦級核反應器。 　　THOR係一多用途且俱有先天安全特性之研究用反應器，民國51年10月達到初次全功率運轉，額定熱功率為1MW，能提供足夠的功率及中子通率，對於許多研究領域的瞭解及工作成效，有相當大的助益，這些領域包括物理、化學、工程、醫學及材料科學等方面之研究。 　　THOR運轉之初，使用之鈾燃料為濃縮度20%之MTR(Material Testing Reactor) 片狀燃料，至民國59年轉換為93%高濃縮度之同型鈾燃料。由於國際間防止核武擴散政策，使得高濃縮度鈾燃料之取得日益困難，因此THOR自66年7月起逐步更換使用GA（General Atomic）公司所製造的TRIGA（Training Research Isotope-production built by GA）型低濃縮度（20%）棒狀燃料，於76年8月，THOR爐心燃料已全數更換為TRIGA燃料。 　　THOR自民國80年以來，已逐年更新且完成的項目有：（1）熱交換器（80年1月）；（2）儀控系統，更換為GA公司微電腦控制系統（82年6月）；（3）冷卻水塔（82年6月）；（4）冷卻水儲存槽（82年6月）；（5）爐心鋁合金燃料格架更新（87年）。 民國87年經原子能委員會核可後，將額定功率提升至2 MW。 THOR於四十年運轉執照將屆之際，在2000年經原子能委員會核可，取得為期十年之更新執照。 　　阿岡諾反應器(THAR)於民國80年5月因安全考慮因素而暫停運轉。民國81年6月清華大學向原子能委員會（AEC）提出THAR除役工作計畫書，申請核准進行除役之工作並於同年12月獲得AEC核准THAR除役工作之執行。之後，先經妥善周延的事前準備與人員訓練後，始於民國82年2月8日對外召開記者會，正式揭開國內首座研究用反應器除役工作─THAR除役工作之序幕。THAR除役後，反應器廠房在獲AEC核准以一般建築物方式拆除，已於民國83年3月22日將反應器廠房拆除完畢並於同年11月底完成THAR紀念花園。 清華移動教學反應器(THMER)於民國64年11月達初次臨界，已於民國92年9月完成除役。